實驗室廢水處理的原理是將高濃度的廢酸堿液經中和后排放至中性。高濃度有機溶劑中含有少量被測物質和其他試劑應回收利用。用于回收的高濃度廢水應集中存放回收，低濃度廢水處理后排放，根據廢水性質確定貯存容器和貯存條件。不同的廢水一般不允許混合，避免光照，遠離熱源，以避免不良的化學反應。廢水儲存容器必須貼上標簽，注明類型、儲存時間等。